COMAR advanced training workshops on deep-sea benthos

 

2nd  workshop: Systematics (Mollusca and Crustacea) and Sampling Methods

   Nov 9 to Nov 20, 2015, HKUST, HONG KONG

                 Instructors: Drs Greg Rouse, Alan Jamieson and Janet Voight

 

Nov 8 Welcome gathering, 6pm

 

Nov 9 (Monday) Instructor Greg Rouse

9:00 -10:30 Introduction to workshop

  Lecture 1

Introduction to systematics, tree-thinking, basic terminology.Parsimony, tree searching, multiple equally parsimonious trees & consensus. Character coding.

10:45 -12:15 Lecture 2

Molecular sequence data.Alignment.

12:15- 14:00 Lunch

14:00- 17:30 Computer Exercises

Nov 10(Tuesday) Instructor Greg Rouse

9:00 - 10:30 Lecture 3

Alternatives to Parsimony: Distance methods, Models and Maximum Likelihood, Bayesian

10:45 – 12:15 Lecture 4

Combining Data, Hypothesis testing

12:15 – 14:00 Lunch

14:00 – 17:30 Computer Exercises

Molecular data 1.Basic Alignment and Parsimony Analysis.GenBank. Using Clustal and MUSCLE in Mesquite.

Nov 11(Wednesday) Instructor Greg Rouse

9:00 - 10:30 Lecture 5

Current Nomenclature; Biodiversity measurement; taxonomic surrogacy

10:45 – 12:15 Lecture 6

Historical biogeography, Phylogeography, Key innovations and diversification rates, Fossils, molecular clocks and dating on trees

12:15 – 14:00 Lunch

14:00 – 17:30 Computer Exercises

Species exercise. Taxonomy exercise; Linnean and Phylocode. Integrating geography & DNA

Nov 12(Thursday)  Instructor Janet Voight

9:00 -10:30 Lecture 7

Mollusca 1 Bivalves?

10:45 -12:15 Lecture 8 

Mollusca II Gastropods?
12:15- 14:00 Lunch

14:00- 17:30 Field trip to collect specimens from local habitats

 

Nov 13(Friday)  Instructor Janet Voight

9:00 -10:30 Lecture 8 

Mollusca III Cephalopods?

10:45 -12:15 Lecture 9

Mollusca IV Habitats and Patterns?

12:15- 14:00 Lunch

14:00- 17:30 Identification/Discussions

Nov 14(Saturday)

9:00 -17:30 Trainees to work on group/individual mini-projects, molecular/ morphological data. Course Leaders to come up with some deep-sea questions to be assessed in the time frame available.

 

Nov 15(Sunday)

9:00 -12:15 Trainee's group project
12:15- 14:00 Lunch

14:00- 17:30 Presentation and discussion of group mini-projects

18:00 – 21:00 Social gathering to Stanley market

Nov 16 Day off

Nov 17 Instructors Greg Rouse/ Alan Jamieson

9:00 -10:30 Lecture 10 

Crustacea (Greg)

Overview of Crustacea

10:45 -12:15 Lecture 11 AlanJamieson

Deep Sea Amphipods

12:15- 14:00 Lunch

14:00- 17:30 Exercises/Discussions

 

 

Nov 18

9:00 - 10:30 Lecture 12: Alan Jamieson

Benthic megafauna in the abssyal/hadal zones…

10:45 – 12:15 Lecture 13: Alan Jamieson

Biolumiscence

12:15 – 14:00 Lunch

14:00 – 17:30 Exercises/Discussions

 

Nov 19
9:00 - 10:30 Lecture 14: AlanJamieson

Technology for biological research at depth I

10:45 – 12:15 Lecture 15: AlanJamieson
Technology for biological research at depth II

 

12:15 – 14:00 Lunch

14:00 – 20:30 Second field trip with dinner gathering

 

Nov 20

Wrap up workshop

9:00 – 12:00 Round-table discussion on future collaboration

12:00 - 15:00 Lunch

15:00 – 17:00 Concluding workshop

18:00 – 21:00 Closing gathering

 

Nov 21  Departure

 

     1   2